ジョイント部の千鳥孔（３００㎜以上のＦＬＧ）でスタートが内から始める設計者と外から始める設計者と終わりを内にと言う設計者といろいろな方がいます。何か基本があるのでしょうか。

基本的にはボルトを締めることによる歪が内側の拘束性が大きいところから外側の拘束が解除されやすい方向に、板の歪が逃げられる方向に向けて閉めてゆくことが基本です。内側から始めて外側にて終わるような配列が基本と考えるべきでしょう。
ＪＡＳＳ６（２００７）「図６．２　ボルト締め付け順序」をご参照ください。